Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRAMD4Q6IC98 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms