Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCAF6Q58WW2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms