Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TRIM16LQ309B1 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRIM16LQ309B1 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms