Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LETM2Q2VYF4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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