Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHL40Q2TBA0 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms