Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SGSM1Q2NKQ1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms