Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC96Q2M329 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms