Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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PTPROQ16827 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTPROQ16827 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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