Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PCSK7Q16549 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCSK7Q16549 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms