Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ZFHX3Q15911 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZFHX3Q15911 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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