Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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