Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TAF1AQ15573 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms