Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYTH1Q15438 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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