Protein–RNA interactions for Protein: Q14397

GCKR, Glucokinase regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCKRQ14397 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCKRQ14397 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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