Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCARF1Q14162 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
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