Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM29Q14134 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms