Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CKAP5Q14008 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms