Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEUROD1Q13562 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEUROD1Q13562 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms