Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMAD4Q13485 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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