Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CBX3Q13185 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CBX3Q13185 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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