Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRDM2Q13029 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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