Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HSPB3Q12988 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms