Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PTP4A2Q12974 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PTP4A2Q12974 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTP4A2Q12974 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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