Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NFIAQ12857 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NFIAQ12857 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms