Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ELP6Q0PNE2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ELP6Q0PNE2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms