Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFFO1Q0D2I5 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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