Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA3Q08378 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA3Q08378 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 374.4 ms