Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
KRTAP1-1Q07627 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
KRTAP1-1Q07627 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms