Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHRNEQ04844 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms