Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GBE1Q04446 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms