Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMC1P62191 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms