Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HERVK_113P61574 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms