Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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