Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CLDN17P56750 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms