Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MANFP55145 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MANFP55145 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MANFP55145 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
MANFP55145 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
MANFP55145 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
MANFP55145 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
MANFP55145 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MANFP55145 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms