Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF135P52742 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF135P52742 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms