Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2A2P52657 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms