Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KPNA1P52294 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
KPNA1P52294 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KPNA1P52294 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
KPNA1P52294 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KPNA1P52294 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms