Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNQ1P51787 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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