Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CRIP1P50238 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms