Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

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Length 1,807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TSC2P49815 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TSC2P49815 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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