Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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KRT6CP48668 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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