Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCT5P48643 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCT5P48643 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCT5P48643 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms