Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP8P40818 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
USP8P40818 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
USP8P40818 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms