Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FDFT1P37268 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms