Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXC9P31274 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXC9P31274 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms