Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GTF2E1P29083 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GTF2E1P29083 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms