Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TAF1P21675 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TAF1P21675 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TAF1P21675 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms