Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DESP17661 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DESP17661 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DESP17661 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DESP17661 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DESP17661 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DESP17661 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DESP17661 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DESP17661 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DESP17661 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DESP17661 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms