Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC130P13994 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC130P13994 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms